Najkrajší, najvzácnejší, umelecky najhodnotnejší gotický krídlový oltár baziliky. Jeho vznik sa datuje do rokov 1480 – 1490. Fundoval a opatroval ho v minulosti cech bardejovských tkáčov. Pozornosť púta na seba nádherná drevorezba kľačiacej Bohorodičky tak svojou veľkosťou, ako aj prevedením. Pred ňou sa nachádza novorodeniatko obklopené piatimi anjelmi. V pozadí je mesto a skupina pastierov s ovcami a nad všetkým sa vznášajúci anjeli so stuhou s nápisom Gloria in excelsis Deo. Po boku skrine sú sochy 4 najuctievanejších svätíc stredoveku: sv. Doroty, sv. Barbory, sv. Margity a sv. Kataríny. V strede predely je umiestnená plastika Poklony troch kráľov a po stranách plastiky znázorňujúce Zvestovanie a Navštívenie. Tabuľové maľby na krídlach nám pri svojom otvorení približujú udalosti zo života Panny Márie, pri uzatvorení krídel pašiový cyklus.